Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Krt20Q9D312 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Krt20Q9D312 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Krt20Q9D312 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Krt20Q9D312 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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