Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D2Q3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms