Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Mrpl28Q9D1B9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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