Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms