Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufs4Q9CXZ1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms