Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SdhdQ9CXV1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms