Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

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Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tdrd12Q9CWU0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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Tdrd12Q9CWU0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Tdrd12Q9CWU0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Tdrd12Q9CWU0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Tdrd12Q9CWU0 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Tdrd12Q9CWU0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
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Tdrd12Q9CWU0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tdrd12Q9CWU0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms