Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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