Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PompQ9CQT5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PompQ9CQT5 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms