Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Smim8Q9CQQ0 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Smim8Q9CQQ0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.4 ms