Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM5

Txndc17, Thioredoxin domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc17Q9CQM5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Txndc17Q9CQM5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms