Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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