Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpa3Q9CQ71 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rpa3Q9CQ71 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rpa3Q9CQ71 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rpa3Q9CQ71 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpa3Q9CQ71 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms