Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Rpl17Q9CPR4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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Rpl17Q9CPR4 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl17Q9CPR4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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