Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim26Q99PN3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms