Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NsmfQ99NF2 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms