Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ubqln4Q99NB8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ubqln4Q99NB8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ubqln4Q99NB8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ubqln4Q99NB8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ubqln4Q99NB8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ubqln4Q99NB8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ubqln4Q99NB8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ubqln4Q99NB8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
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Ubqln4Q99NB8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ubqln4Q99NB8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ubqln4Q99NB8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ubqln4Q99NB8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ubqln4Q99NB8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ubqln4Q99NB8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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