Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms