Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms