Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ophn1Q99J31 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms