Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Smim11aQ99J19 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim11aQ99J19 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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