Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CsprsQ99388 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms