Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Csmd1Q923L3 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms