Protein–RNA interactions for Protein: Q920C4

Ms4a3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a3Q920C4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ms4a3Q920C4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms