Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rhbdd2Q8VEK2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms