Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc115Q8VE99 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms