Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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