Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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