Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q8VCE4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8VCE4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8VCE4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8VCE4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8VCE4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8VCE4 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8VCE4 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8VCE4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8VCE4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8VCE4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8VCE4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8VCE4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8VCE4 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8VCE4 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8VCE4 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8VCE4 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8VCE4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8VCE4 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q8VCE4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms