Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5M0

Gipc3, PDZ domain-containing protein GIPC3, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc3Q8R5M0 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gipc3Q8R5M0 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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