Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5C8

Rdh9, Cis-retinol/androgen dehydrogenase type 3, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh9Q8K5C8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rdh9Q8K5C8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rdh9Q8K5C8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rdh9Q8K5C8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rdh9Q8K5C8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rdh9Q8K5C8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rdh9Q8K5C8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh9Q8K5C8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rdh9Q8K5C8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Rdh9Q8K5C8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rdh9Q8K5C8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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