Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vrk3Q8K3G5 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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