Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms