Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms