Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ccdc38Q8CDN8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Ccdc38Q8CDN8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc38Q8CDN8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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