Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spef2Q8C9J3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spef2Q8C9J3 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms