Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms