Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cnot2Q8C5L3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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