Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4D8

Gm11541, Predicted gene 11541, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11541Q8C4D8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm11541Q8C4D8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms