Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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