Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ube3dQ8BX13 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ube3dQ8BX13 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ube3dQ8BX13 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ube3dQ8BX13 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ube3dQ8BX13 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ube3dQ8BX13 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ube3dQ8BX13 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ube3dQ8BX13 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ube3dQ8BX13 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ube3dQ8BX13 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ube3dQ8BX13 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Ube3dQ8BX13 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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