Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Usp38Q8BW70 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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