Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Pggt1bQ8BUY9 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Pggt1bQ8BUY9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Pggt1bQ8BUY9 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Pggt1bQ8BUY9 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Pggt1bQ8BUY9 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Pggt1bQ8BUY9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Pggt1bQ8BUY9 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Pggt1bQ8BUY9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Pggt1bQ8BUY9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms