Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Slc5a7Q8BGY9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Slc5a7Q8BGY9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Slc5a7Q8BGY9 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Slc5a7Q8BGY9 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Slc5a7Q8BGY9 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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