Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Zbed4Q80WQ9 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Zbed4Q80WQ9 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Zbed4Q80WQ9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Zbed4Q80WQ9 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms