Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Lrrc1Q80VQ1 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lrrc1Q80VQ1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Lrrc1Q80VQ1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Lrrc1Q80VQ1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Lrrc1Q80VQ1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Lrrc1Q80VQ1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Lrrc1Q80VQ1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Lrrc1Q80VQ1 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Lrrc1Q80VQ1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrc1Q80VQ1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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