Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rexo1Q7TT28 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms