Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PhkbQ7TSH2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PhkbQ7TSH2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PhkbQ7TSH2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PhkbQ7TSH2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PhkbQ7TSH2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PhkbQ7TSH2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PhkbQ7TSH2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PhkbQ7TSH2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PhkbQ7TSH2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PhkbQ7TSH2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PhkbQ7TSH2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PhkbQ7TSH2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms