Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms