Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ckap2lQ7TS74 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ckap2lQ7TS74 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms